Yoweri Museveni commence donc un 3e mandat, avec 59,3% des voix contre 37% pour le leader de l'opposition, Kizza Besigye. Besigye, leader du Forum pour le changement démocratique (FDC), rejette ces résultats et parle d'une élection "entachée d'irrégularités massives et de négligences".